CircRNA-seq简介
环形RNA是mRNA在剪接的过程中,上游exon的5’端与下游exon的3’端剪接到一起,从而形成的首尾相接的环状RNA分子。早在1993年,性别决定基因SRY的mRNA就被发现可以形成环状RNA,且在睾丸中具有很高的丰度。近来的研究表明,高等动物中环状RNA的种类和含量远远超过预 期。但是对于这些circular RNA的功能,目前还知之甚少。近期的研究发现circular RNA可以作为“microRNA海绵”,竞争结合microRNA从而解除这些microRNA对其他靶标的调控;同时保守型分析发现环状RNA上潜在具有多种RNA结合蛋白的结合位点,暗示circular RNA可以调控RNA结合蛋白的功能。更为重要的是,circular RNA的表达呈现出很强的组织特异性,暗示这些circular RNA具有重要的生物学功能。
技术路线
