16s rDNA测序
16SrDNA测序是细菌基因组中编码核糖体16S rRNA分子所对应的DNA序列,序列全长约1540bp,由10个保守区和9个可变区(V1-V9)组成。保守区序列在细菌间差异不大而高变区则具有种属特异性,因此比较常用作细菌分类标准。通过提取环境样品DNA,扩增其中16S rDNA基因(常见扩增区域:V×4区、V3-V4区、V4-V5区),对片段进行高通量测序并与细菌注释数据库比对,从而完成对样品细菌种类、丰度、差异菌群和系统进化等诸多信息分析。这对于研究微生物菌群和疾病之间的发病机制等方面发挥着重要的作用。
应用方向
1.健康和疾病人群细菌分类鉴定、属菌丰度统计、差异菌群Biomarker筛选
2.疾病与微生物菌群之间发病机制的研究。
技术路线
